当我们的基因表达分类器包含排行榜的前22、30、34、36、38、40、 42、44、46、48、50、80、84或86个基因时,LOOCV过程中的预测错误 为0。 对于每一个分类器, 我们设置风险系数的门槛值,将44个病人分为15个高风险和29个低风险的病人。 同时,我们计算独立于训练样本的13个验证样本的风险系数。 通 过前面设置的风险系数的门槛值,我们可判定这13个验证样本的基因组风 险的高低。 同样地,我们也统计验证组病人的基因组风险和实际临床预后出 现不一致的次数。
化疗的副作用很多,尤其是其中的转氨酶高就很有可能损伤肝脏,患者需要正确治疗。 化疗痛苦 易瑞沙吉非替尼片作为EGFR突变型的靶向药物,在对非小细胞肺癌的疗效还是显著的… 化疗痛苦 癌胚抗原是在胚胎时胃肠道、肝、胰腺合成的一种蛋白质,癌胚抗原是一个广谱性肿瘤标志物,它能向人们反映出…
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8.根据权利要求1所述的预测肺癌病人预后的基因表达分类器的构建方法,其特征在于,所述第二阶段采用KM生存分析计算高风险组和低风险组之间的时序检验p值,时序检验p值最小的Cox模型所包含的基因种类和数目就是所构建的基因表达分类器。 化疗痛苦 另一方面,本发明的目的是提供一种预测肺癌病人预后的基因表达分 类器的构建方法,其中对所有基因的表达和预后情况的Pearson系数的绝对 值由大到小排序,获得与真实一年内复发高度相关的基因。 7.根据权利要求1所述的预测肺癌病人预后的基因表达分类器的构建方法,其特征在于,所述第二阶段,包括特征排序,所述特征排序基于单因素的Cox比例风险回归模型所得p值进行。 另一方面,本发明的目的是提供一种预测肺癌病人预后的基因表达分 类器的构建方法的构建方法,其中验证阶段使用芯片数据集验证所获得的 基因表达分类器。
近距离的目睹死亡,是一种心惊肉跳的体验,无法描述的可怕。 尤其是癌症这种恶魔,像一个魔鬼,随时把鲜活生命给吞没,从常人的视角来看,它是恶的,它夺走了你的亲人,夺走了你的爱,剥夺了生者享受生活之美好的权力,它是一种摧毁了美好计划的暴行。 对于肺癌胸腔积水怎样治疗,对症治疗是关键,需要利用其它放化疗方式和中药治疗,以达到消除胸水的目的,利… 化疗痛苦 化疗自然是非常痛苦的,大家都非常关心,因为它是和顽强的癌细胞做斗阵,自然患者在治病时非常难受。
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另一方面,本发明提供一种预测非小细胞肺癌病人预后的基因表达分 类器的构建方法,其中所述训练阶段包括第一阶段和第二阶段。 另一方面,本发明提供一种预测非小细胞肺癌病人预后的基因表达分 类器的构建方法,其包括:数据训练阶段和验证阶段。 另一方面,本发明的目的是提供一种预测肺癌病人预后的基因表达分 类器的构建方法,其中第一阶段的基因表达分类器雏形包含有基因列表。 另一方面,本发明的目的是提供一种预测肺癌病人预后的基因表达分 类器的构建方法,其中使用LOOCV方法获得最佳的基因类别和数目,从 而构建所述基因表达分类器雏形。 9.根据权利要求1所述的预测肺癌病人预后的基因表达分类器的构建方法的构建方法,其特征在于,验证阶段使用芯片数据集验证所获得的基因表达分类器。 最好的分类器在LOOCV过程中,错误计数器收集的预测错误次数应该 最少。
如此循环,直到所有的特征都被纳入Cox 回归模型。 时序检验p值最小的Cox模型所包含的特征种类和数目就是最优 的。 另一方面,本发明的目的是提供一种预测肺癌病人预后的基因表达分 类器的构建方法,其中使用基因表达分类器雏形计算用于验证的肿瘤样本 的风险系数,预测其复发风险,通过比较真实复发风险和预测复发风险的一 致性,验证所述基因表达分类器雏形的效能。
化疗痛苦: CN107292127A – 预测肺癌病人预后的基因表达分类器及其构建方法
我们在分类器的验证阶段用的是基因芯片表达数 据集,这些芯片来自于不同的版本,包括GPL570、GPL7015、GPL6480 以及GPL96。 这些芯片平台中,并不是都能找到相应的探针来分别对应 分类器中的19个基因。 在GPL570、GPL7015、GPL6480以及GPL96中, 19个基因中分别仅有17、9、12和6个基因可以找到相应的探针。 因此 在利用这些平台的基因芯片数据集进行验证时,我们只能提取17、9、12 或6基因的表达值进行加权相加。 出乎意料的是,这些所谓的“不完整 的分类器”依然表现出非常强的预测功效。 有监督的分类方法:将挑选出来的基因按照相关系数的绝对值从大到小 化疗痛苦 进行排序,得到一个排行榜,从排在最前面的两个基因开始,每次从排行榜 再依次添加两个基因建立一个分类器,如此循环,直到排行榜中所有的基因 都被作为报告子用尽,建立基因表达分类器雏形。
通过进行基因群组(panel)的基因表达检测,高风险的基因风险评分的非小细胞肺癌病人应该接受辅助治疗,而低风险的基因风险评分的非小细胞肺癌病人应该接受低剂量或免于辅助治疗。 基于训练的第一阶段获得的80-基因分类器,我们进一步运用机器学习 的方法获得更加简洁的风险评分系统来预测肺癌病人的预后。 同样是运用 TCGA的病人数据,但是这次囊括了所有未接受和接受了术后放疗的病人, 这样总共有350个肺腺癌样本可用。 关注癌症病人的无复发生存期 (Relapse-Free Survival,RFS)。 另一方面,本发明提供一种预测非小细胞肺癌病人预后的基因表达分 类器的构建方法,其中所述第一阶段包括:使用未接受术后放疗的TCGA 肺腺癌病人的基因表达信息和临床信息,使用有监督的机器学习方法建立能 预测肺腺癌病人预后的基因表达分类器雏形。
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很显然,1470个基因对于分类器来说数目太过庞大,基因数目需要优 化。 将这1470个基因按照相关系数的绝对值从大到小进行排序,得到一个 排行榜。 从排在最前面的两个基因开始,每次从排行榜再依次添 加两个基因建立一个分类器,如此循环,直到排行榜中所有的1470个基因 都被作为报告子用尽,因此总共建立了735个分类器。 所以,生物学上来说死亡是人体免疫系统越来越臃肿导致逐渐失去了防御能力,外加细胞复制的错误命中率增加导致肿瘤细胞基因突变增加,导致生命系统逐渐走向崩溃。 生物学上,人体免疫系统在老年的时候,会逐渐失效,对外界的防御会失去抵御能力;另外,细胞复制的过程中会存在错误,这种错误率很低,但是随着时间的拉长,细胞复制的错误命中率会加大,就增大了例如肿瘤细胞基因突变的可能性,因此出现更多的癌症几率。 我们发现原初的1470个基因中绝大多数 的基因都存在于这44个分类器中(图2)。
3.根据权利要求2所述的预测肺癌病人预后的基因表达分类器的构建方法,其特征在于,对所有基因的表达和预后情况的Pearson系数的绝对值由大到小排序,获得与真实一年内复发高度相关的基因。 X轴是分类器中 报告子(基因)的数目;Y轴是预测错误次数。 采用前22、30、34、36、 38、40、42、44、46、48、50、80、84和86个基因的分类器分别实现了最 少的错误次数。 B:利用额外的包含13个肿瘤的测试集验证上述的分类器的 性能。 80-基因和84-基因分类器实现了最低的错误次数。
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脱发是很多女性朋友最不愿看到的副反应,但只有少部分化疗药物会导致脱发,而且脱发只是暂时现象,化疗结束后不久就会又恢复一头健康的头发。 而像肝肾功能损伤,静脉炎,心肺功能损伤,外周神经炎等相对来说反应较轻,只要肿瘤医生合理用药,并且采取相应的对症措施,一般不会导致很严重的后果。
- 最好的分类器在LOOCV过程中,错误计数器收集的预测错误次数应该 最少。
- “领会”则是通过自己的选择,在自己的本真的状态中“显示”给自己或他人,从而帮助他认识和找到自己,并且通过思考死亡,直面死亡,本真的“怀着畏惧”的向死而存在,这是另一种此在的生存的可能性。
- 根据良好预后组和差预后组的平均表达模式的相关性对肿瘤进行 排序(左图)。
- 我打开了我的日记,看了当年和我父亲在上海的医院住院一起抗癌半年直到死亡的日记,又一次的陷入了当年的巨大痛苦之中,这对我来说是一次重大灾难和人生打击。
- 应当强调,本发明的上述实施例仅仅是可能的示例实施方式,其仅 仅是为了清楚地理解本公开的原理而提出的。
- 可作为独立的非小细胞肺癌预后(总体生存期和无复发生存期)强 诊断因子。
首先是癌症的身体痛苦极大,对病魔的恐惧,以及心理难以平复和战胜病魔。 我父亲的癌症的痛苦我不能感同身受,但是我看他的表情和体重的骤降是知道,化疗是极其极其极其痛苦的,癌症绝对是对生命的残暴暴行。 在这种情况下,能用精神战胜病魔是需要多强大的意志,我无法想象。 当然,现在医学上出现了靶向药物,或许能减缓一些痛苦,但具体到每一种癌症的效果是不同的。 化疗的另外一种严重的副反应是骨髓抑制,即降低白细胞、血小板及红细胞的作用,这才是化疗药物的最严重的毒副反应。 不过现在治疗骨髓抑制的新药物非常多,疗效也较好。
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我和保罗一样,经历了恐惧→否认→愤怒→ 讨价还价→ 消沉→ 接受。 最后我也鼓励父亲勇敢的接受死亡,死亡是新生,是物质世界的一种解脱,是生命的升华。 惧怕死亡只是被自己吓到,用平常心看待死亡,生是日常,死是日常,生与死对宇宙都是不增不减,只是自然规律的运作而已。
所有 这些修改和变化旨在被包括在本发明的范围内并由所附权利要求保护。 图2是以无信息遗露的方式产生的44个基因表 达分类器中,原初的1470个基因(红色)和其它基因(蓝色)的分布示意 图。 在一个基因表达分类器中,报告基因的平均数目是1523±98。