1998年7月11日：往藍田方向，離開地面運輸中心後，直接取道暢連路往機場南交匯處，不再繞經暢達路。 近年不少荷里活電影在土瓜灣取景，其中《世紀戰疫》、《變形金剛4》、《斯諾登風暴》等在益豐大廈取景。 土瓜灣新商場 而啟明街、美景街及十三街附近的工廠大廈曾為香港電視劇集取景地，如《大時代》拍攝美景街的甘露甜品店和鄭保瑞的《狗咬狗》。
踏入廿一世紀，九巴加入低地台服務，用車以丹尼士三叉戟12米（ATR）及富豪超級奧林比安12米（3ASV）為主，其後引入富豪B9TL 12米（AVBE，已全數調走）及Enviro500 12米（ATE／ATEU，已全數調離）。 2012年1月至8月期間，更一度全線以配置歐盟五型環保引擎的富豪B9TL（AVBWU，於2018年12月重新加入，至2021年3月再次撤離，至2022年6月再次重新加入）行走（詳見連環毀壞座位段落）。 2015年9月中，因應政府收緊專營巴士低排放區政策，新巴將大量Neoplan Centroliner（60XX）投放於此路線，以騰出符合低排放要求的用車行走途經銅鑼灣低排放區的路線，直至該批車輛退役為止。 106線因定線遠比油蔴地小輪西灣河至九龍城渡輪航線迂迴，以至106線客量偏低[註 2]，因此在1980年代末期曾一度淪為養老線，尤以中巴的班次為甚。
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路線開辦初期，兩巴用車均以丹拿珍寶（九巴：D，中巴：LF）為主。 其後九巴改派利蘭勝利二型（G）及丹尼士喝采（N），中巴亦改派利蘭勝利二型（LV）。 2000年：新巴班次提升為全空調服務，象徵全線全空調服務；同年，來往九龍城碼頭之非常規特別班次取消。
配合前啟德機場精彩的重建規劃和東南九龍發展計劃，全新全面的城市規劃正打造翔龍灣廣場為東九龍的魅力焦點。 翔龍灣位於土瓜灣新碼頭街38號（中原樓市片區：土瓜灣）。 屯馬綫宋皇臺及土瓜灣兩個新站正式啟用，相信會吸引不少市民前往九龍城區消遣，今次率先為大家介紹當區4個復古味濃的美食及尋寶景點，適合鍾情港式美食又喜歡打卡的你。
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當時兩巴傾向派出載客量不多於125人的雙層巴士行走此路線，由於當時兩軸巴士的載客量少於125人，從而推斷長度限制應不長於10.7米。 後來這些巴士逐步與101線的Enviro500 12米（ATE）交換。 2021年4月10日：一輛往小西灣方向的九巴Enviro500 MMC（ATENU531／TK8569）準備停靠馬頭圍道「紅磡街市」站時與的士相撞。
2011年1月2日：受廣深港高鐵西九龍總站工程影響，連翔道近西九龍總站地盤的南行綫須臨時封閉，往慈雲山方向改經臨時D1A路，然後返回佐敦道及原有路線。 2008年8月25日：往機場方向設於駿運路東行的「駿坪路」及「機場空運中心」站永久取消，改停兩站之間的新分站「機場空運中心」。 土瓜灣新商場 1999年6月14日：往機場方向改經船景街、紅鸞道（西行）、迴旋處、紅鸞道（東行）、紅樂道及紅荔道前往紅磡南道，不再從紅磡道直接右轉紅磡南道。
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住客會所設於3樓，提供共享空間、戶外燒烤區、室外遊樂場及24小時健身室等多項設施，另設有有蓋花園及綠化空間。 喜築是由麗新發展及市區重建局合作發展的土瓜灣樓盤項目，位於九龍城馬頭角炮仗街93號及新山道20至32號，已於2018年12月入伙。 土瓜灣新商場 喜築樓高28層，合共提供209個住宅單位，單位實用面積為294至1,273平方呎，間隔為開放式至3房。 住客會所設於2樓，包括健身室、休閒雅座及花園平台等多項設施。 津匯位於九龍城道6號及8號、浙江街44號，由寶聲集團、其士國際及市區重建局合作發展的土瓜灣樓盤項目，已於2017年5月入伙。
2016年6月市建局宣佈在土瓜灣推出3個以小區重建發展概念的項目，涉及鴻福街、銀漢街、啟明街及榮光街合共97個街號。 地盤總面積約8840平方米，樓齡逾50年，估計發展成本需100億港元。 預計2025/26年完成後，會提供1360個中小型單位，設12,200多平方米商業/零售樓面面積，市建局聲稱日後不會引入大型商場，將以小店為主，同時優化區內交通。 當中最為街坊不捨的是有20年歷史被稱為「街坊食堂」 的潮汕美食。 土瓜灣新商場 土瓜灣新商場 餐廳位置隱蔽，位於環海東岸的商場，因此小店並不多人認知，卻是一間價格平民的日本餐廳。
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津匯交通方便，距離港鐵屯馬綫土瓜灣站約2分鐘步行路程。 樓高28層，共提供175個單位，單位實用面積為221至1,551平方呎，採開放式至3房設計。 大廈3樓設有住客會所，包括戶外泳池、健身室、燒烤庭園及多用途活動空間等多項設施；另有園林式空中花園連兒童遊樂場。 屯馬線土瓜灣站開通後，除了該區新盤備受關注之外，同區單幢式半新盤也吸引準買家物色放盤單位。 土瓜灣半新盤項目在生活配套上有兩大賣點，就是附近有多條巴士及小巴路線途經，來往港九多處地方十分便利；區內民生商店、食肆林立，還有多個購物商場，滿足住戶日常生活所需。 瑧尚位於馬頭角九龍城道68號，是鄰近屯馬綫土瓜灣站的新樓盤，由新世界發展及市區重建局合作發展，於2021年4月開始收樓。
- 本公司在未得閣下的同意之前，不能如此使用閣下的個人資料並向閣下作直接促銷。
- 城巴有限公司，〈路線E11, E11A, E21, E22, E22A, E22P, E22X, E23, N11, N21, N21A, N23, N26, N29, S1, S56取消四號停車場巴士站及改道〉［乘客通告］，2017年3月24日。
- 翰畋是由高譽投資發展的土瓜灣樓盤項目，位於九龍土瓜灣美善同道80號，距離港鐵屯馬綫土瓜灣站約2分鐘步行路程，於2019年12月入伙。
- E23／E23A（往慈雲山（南）方向）$1.090分鐘注意事項：乘客需使用同一張八達通卡以享用上述轉乘優惠。
- 另外於土瓜灣道及馬頭圍道沿線亦有多條巴士及小巴路線，來往港九新界多處地方。
- 單位實用面積介乎280至561平方呎，間隔有1至3房選擇。
如涉及跨公司轉乘，則不可使用電子支付方式付款，否則會沒有轉乘優惠。 乘客亦可使用AlipayHK「易乘碼」、支付寶或雲閃付「乘車碼」、具有感應式支付功能的VISA、Mastercard及銀聯卡，以及Apple Pay、Google Pay及Samsung Pay流動支付平台繳付車資。 乘客使用上述付款方式，將只可享有與其他城巴／新巴獨營路線或聯營線城巴／新巴班次之轉乘優惠，亦不能享有「公共交通費用補貼」及「長者及合資格殘疾人士乘車優惠計劃」。 1950年代初土瓜灣仍較為荒蕪，區內主要為工廠，直至六十年代才漸漸發展起來。 商舖主要集中在土瓜灣道，工廠大廈和住宅式工場則於九龍城道與馬頭圍道，後因工業轉營，工廠慢慢搬遷，部份工廠大廈演變成現在內地旅行團購物的地方。 土瓜灣新商場 Soda Mall為九龍建業開展自家零售業務的項目，而在紅磡店開幕前，在旗下另一物業始創中心已設有首間分店，但規模則不及紅磡店。
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E23／E23A（往慈雲山（南）方向）$1.090分鐘注意事項：乘客需使用同一張八達通卡以享用上述轉乘優惠。 1999年7月24日：配合紅磡繞道7月13日通車後，紅磡灣一帶實施新交通管理措施，往機場方向離開黃埔花園後，改經紅磡繞道、迴旋處、紅鸞道、紅樂道、紅荔道往紅磡南道。 在芸芸城巴大嶼山北部對外路線中，只有E23與輔助路線E23A以地面運輸中心為總站；兩線往機場方向之電牌會顯示「赤鱲角」，並非城巴機場快線慣用的「機場」。 自1998年啟德機場關閉後，有不少新私人屋苑在土瓜灣落成，也有不少工業租戶陸續遷往九龍東之新蒲崗、九龍灣、觀塘和油塘等。
「馬頭角十三街」，鼎鼎大名，是舊區土瓜灣的著名地帶。 馬頭角十三街由13條街道組成，當中有11條全直街道，街名字首分別以11隻寓意吉祥的瑞獸，龍、鳳、鹿、麒麟等命名。 十三街歷史悠久，這一帶的樓宇樓齡逾半世紀，龐大的唐樓群外表並不光鮮，但七彩顏色勝在夠特色。
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招牌必食、北海道製的鬆脆可樂餅有五種口味，包括洋蔥、紫芋甘粟、南瓜、芝士和牛肉。
